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Trainings 2019 – Advanced HPC

Formation HPC avancé

This course continue à expliquer comment travailler sur les clusters South Green. Il est à destination d'utilisateurs expérimentés désireux d'acquérir de nouvelles méthodes de travail. De nouvelles notions et outils seront présentés tels que les job arrays, l'installation basique de logiciels, la création de module environment et l'utilisation de Singularity.

Pré-requis

Bases Linux

Formation HPC

Programme

  • Installer vos propres logiciels
  • Lancer des job arrays avec SGE
  • Créer vos propres module environments
  • Utiliser un conteneur Singularity
  • Installer Singularity sur votre ordinateur
  • Créer son propre conteneur Singularity et l'utiliser sur le cluster

Objectifs

Après ce cours, les participants seront capables de:

  • Installer un logiciel de base
  • Lancer un job array
  • Créer un module environments
  • Créer un conteneur Singularity

Support de cours

  • Présentation : ici
  • Practice : ici
  • HowTos : ici

Formateurs

  • Ndomassi Tando (NT) - ndomassi.tando@ird.fr
  • Bertrand Pitollat(BP) - bertrand.pitollat@cirad.fr
  • Francois Sabot (FS) - francois.sabot@ird.fr
  • Valérie Noel (VN) - valerie.noel@ird.fr
  • Sebastien Ravel (SR) - sebastien.ravel@cirad.fr

Formations

Date Location Topics Participants Instructors Links Units
2019 IRD Montpellier, France Advanced HPC ALL UMR DIADE,MIVEGEC,AGAP,BGPI