Login Form
Training in bioinformatics, Montpellier (9-13 septembre 2013)
Module algorithmique et bio-informatique (Lundi 09 septembre)
Présentation théorique des grands types d'analyses en bio-informatique (Blast, alignement de séquences, phylogénie, recherche de motif, assemblage)
Application en ligne via des applications Web.
Supports:
- Génomique et bio-informatique (cours, pdf)
- Utilisation de ressources bio-informatiques sur le Web (cours, TD)
Fichiers: gff modifié
Module NGS et Galaxy (Mardi 10 et Mercredi 11 septembre matin)
Présentation de l'outil Galaxy
Traitement de données de séquençage haut-débit (NGS) via Galaxy (nettoyage, assemblage, mapping, recherche de SNP).
Supports:
Module Linux et bio-informatique (Mercredi 11 après-midi, jeudi 12 et vendredi 13 septembre)
- Solution des exercices linux (solutions)