Training in bioinformatics, Montpellier (9-13 septembre 2013)

Module algorithmique et bio-informatique (Lundi 09 septembre)
Présentation théorique des grands types d'analyses en bio-informatique (Blast, alignement de séquences, phylogénie, recherche de motif, assemblage)
Application en ligne via des applications Web.

Supports:

• Génomique et bio-informatique (cours, pdf)
• Utilisation de ressources bio-informatiques sur le Web (cours, TD)

Fichiers: gff modifié

Module NGS et Galaxy (Mardi 10  et Mercredi 11 septembre matin)
Présentation de l'outil Galaxy
Traitement de données de séquençage haut-débit (NGS) via Galaxy (nettoyage, assemblage, mapping, recherche de SNP).

Supports:

• NGS et Galaxy (pdf, odp)
• Recherche et analyse de SNP (cours, TD)

Module Linux et bio-informatique (Mercredi 11 après-midi, jeudi 12 et vendredi 13 septembre)